使用Connector/J连接MySQL数据库，程序运行较长时间后就会报这个错误，有时错误还会提示你修改wait_timeout或是使用Connector/J的autoReconnect属性避免该错误。

错误的原因：

    MySQL服务在长时间不连接之后断开了，断开之后的首次请求会抛出这个异常

原因分析：

    1、既然是长时间不连接之后断开了，那这个时间应该是可以设定的，或者现在mysql用的还是默认的值

    2、如何查看现在的时间值，以及如何修改我的mysql是安装在windows系统上，就以这个说明，若是在开发中mysql安装在linux上，操作步骤几乎一样

查看默认值：

    1、DOC命令启动mysql：mysql -hlocalhost -u用户名 -p密码

    2、查看和连接mysql时间有关的系统变量：show variables like '%timeout%'

1)interactive_timeout:
参数含义：服务器关闭交互式连接前等待活动的秒数。交互式客户端定义为在mysql_real_connect()中使用CLIENT_INTERACTIVE选项的客户端。
参数默认值：28800秒（8小时）

(2)wait_timeout:
参数含义：服务器关闭非交互连接之前等待活动的秒数。
在线程启动时，根据全局wait_timeout值或全局interactive_timeout值初始化会话wait_timeout值，取决于客户端类型(由mysql_real_connect()

的连接选项CLIENT_INTERACTIVE定义)。
参数默认值：28800秒（8小时）

wait_timeout：超时控制的变量，其时间为长度为28800s，就是8个小时，在8个小时之后会断开，需要重新连接，可以在访问的url中使用

jdbc.url=jdbc:mysql://localhost:3306/nd?autoReconnect=true来是连接自动恢复，但这是mysql4及其以下版本使用，在mysql5中已经无效，必须调整系统变量来控制

Mysql5中对wait_timeout和interactive_timeout有两个说明：interactive_timeout：服务器关闭交互式连接前等待活动的秒数。交互式客户端定义为在

mysql_real_connect()中使用CLIENT_INTERACTIVE选项的客户端。又见wait_timeout 

   wait_timeout:服务器关闭非交互连接之前等待活动的秒数。在线程启动时，根据全局wait_timeout值或全局interactive_timeout值初始化

会话wait_timeout值，取决于客户端类型(由mysql_real_connect()的连接选项CLIENT_INTERACTIVE定义)，又见interactive_timeout 

结论：

    若要修改的话，需要同时修改这两个变量

    变量值大小确定：修改的话，如果变量值有范围大小限制，肯定不要超过变量的最大范围值，查资料知：在windows环境中：1-2147483s，

    Linux环境中：1-31536000s

解决方案：

修改MySQL的参数，wait_timeout最大为31536000即1年，在my.cnf中加入： 

[mysqld] 
wait_timeout=31536000 
interactive_timeout=31536000 
重启生效，需要同时修改这两个参数。

如果你使用的是hibernate，需要修改连接池的设置，因为 hibernate自带的连接池性能很差，可以使用C3P0，然后配置： 
test 

c3p0将建一张名为Test的空表，并使用其自带的查询语句进行测试。如果定义了这个参数那么 属性preferredTestQuery将被忽略。你不能在这张Test表上进行任何操 作，它将只供c3p0测试使用。

https://blog.csdn.net/zouxucong/article/details/53924414

https://blog.csdn.net/Amen_Wu/article/details/55292248